细菌过滤效率测试仪的原理主要分为两种，以下是具体的解释：
该原理通过将口罩试样模拟实际使用状态安装到头模样架上，口罩随头模以一定的线速度掠过火焰高度恒定的点火器的上方，观察口罩燃烧情况，记录续燃和阴燃时间，以此评定口罩是否合格。这种方法主要测试口罩的阻燃性能，虽然与细菌过滤效率不直接相关，但在某些测试标准中可能作为辅助测试方法。
细菌过滤效率测试仪更常用的原理是气溶胶法。其测试原理为：在被测样品的上游发生一定浓度的细菌气溶胶，这些细菌气溶胶进入气雾室混合均匀后，进入两路平行的气路采样系统。其中一路在采样器上端加上待检测的样品，另外一端不加样品，作为阳性质控。通过计数阳性质控的值和样品测试的值之间的比值作为泄漏率，从而得出过滤效率。简单来说，就是测量被测样品上游的细菌浓度与下游穿透样品的细菌浓度之比，来确定医用口罩材料的细菌过滤效率（BFE）。
在实际操作中，该测试仪通常由气溶胶发生系统、气雾室与气溶胶传输装置、负压柜、采样器等构成，整个测试仪由控制台进行统一控制。测试时，内部气溶胶发生器提供稳定且可调节的微生物气溶胶流量，内置泵调节流量，使细菌气溶胶以一定流速通过被测口罩材料。然后，通过测量穿透口罩材料的菌落形成单位数量，来评估口罩的细菌过滤效率。
综上所述，细菌过滤效率测试仪的原理主要基于气溶胶法，通过测量细菌气溶胶在口罩材料前后的浓度变化来评估其过滤效率。这种方法具有高精度和可靠性，是医用口罩等防护用品质量检测的重要手段。
